循環(huán)水沖洗廁所的水源取自于糞尿經(jīng)過處理后獲得的潔凈水，有以下兩種方式。

① 尿液單獨處理

這種類型的生態(tài)廁所單獨收集尿液，加入一種藥劑去除異味后，回用于沖洗廁所。糞便被攪碎后變成紙漿狀的東西，干燥后制成肥料還田，也可以作為普通垃圾進行填埋處理。國內(nèi)藍(lán)潔士生態(tài)廁所就是這種類型。日本也有類似的處理裝置，它是通過特殊設(shè)計的糞尿分離裝置完成糞尿的分離。尿液通過微生物作用，脫除氨氮和其它異味氣體回用于沖廁，糞便采用生物處理后外運。

② 糞尿混合處理

這種類型是目前國內(nèi)生態(tài)廁所的主流產(chǎn)品。通過環(huán)境工程的手段,利用微生物的新陳代謝作用和物理化學(xué)作用，完成對糞尿污染物的降解，終轉(zhuǎn)化為CO2 和水排入環(huán)境，同時再生出清潔的水供沖洗廁所使用或直接排放進入環(huán)境。