控制微生物污染的措施純凈水是一種特殊的產(chǎn)品，一旦受到少數(shù)微生物污染，就可能超標，甚至出現(xiàn)絮狀沉淀等后果。因此，控制微生物污染是生產(chǎn)企業(yè)一項非常重要的工作。以上分析表明，控制純凈水微生物污染的措施應該是綜合性的，不能過分強調(diào)某一方面，而忽視了其他方面，因為生產(chǎn)過程中任何一個環(huán)節(jié)受到污染，都會影響產(chǎn)品的質(zhì)量。

1、加強自身衛(wèi)生管理，強化食品衛(wèi)生質(zhì)量意識，指定一名領導負責衛(wèi)生工作，設立專職衛(wèi)生檢驗機構，加強對水源、包裝物、灌裝間空氣和產(chǎn)品檢測，制訂從水源管理、、灌裝、包裝到個人衛(wèi)生各環(huán)節(jié)的衛(wèi)生管理制度，并指定專人監(jiān)督實施，加強食品衛(wèi)生知識的培訓學習，重點掌握方法和明確微生物容易污染關鍵環(huán)節(jié)。

2、根據(jù)水源的特點，合理、科學地設計生產(chǎn)流程，配備必要的水處理和生產(chǎn)設備，選擇符合水的系統(tǒng)。我國礦泉水和純凈水多使用紫外線、超濾和臭氧作為和設施。但多年的經(jīng)驗證明前兩種可靠性差，是造成產(chǎn)品不合格的主要因素，而采用臭氧被認為是目前的方法。

3、定期加強對生產(chǎn)全程的管道，容器和過濾器等有關設施的清理和，做好瓶、蓋和灌裝間的工作。據(jù)了解多數(shù)廠家的管道和包裝物的采用二氧化氯(ClO2)，該具有很強的氧化和作用，但要加強對的質(zhì)量監(jiān)控，保證其效果。