格子門分三個部分。中間一橫條在宋代稱為腰串（清代稱為索腰，日語稱為中棧）、腰串之上留格眼，腰串下安裝障水板（日語作腰板）。除腰串外，格眼約占門高的三分之二，障水板占三分之一。明代的格子門，為了增加亮光，格眼與障水板的比例增加到七比三或八比二。日本、朝鮮、琉球式格子門有部份沒有障水板，只有腰串，腰串上下皆為格眼；也有些亦有些整扇門都是格眼，沒有腰串和障水板。亦有些只有障水板、格眼，沒有腰串。日本稱有障水板、腰串的推拉式格子門為棧唐戶，有障水板的橫拉式格子門則稱為腰付障子。

有些格子門的格眼沒有任何覆蓋物，古代的格子門有些會糊上紙或牡蠣殼片，可遮光和擋風。近現(xiàn)代有些格子門的格眼以玻璃覆蓋，也有些以化學纖維代替紙張作為覆蓋。