高新企業(yè)申報涉及研發(fā)的方面有研發(fā)管理水平和認(rèn)定條件中的研發(fā)費用占比情況，可以說它是評審中影響較大的一塊，可是有些企業(yè)在進行認(rèn)定時總會在研發(fā)這一塊出現(xiàn)問題，具體體現(xiàn)在哪些方面呢？

（一）研發(fā)活動問題

研發(fā)活動問題一方面是企業(yè)引起的，一方面是認(rèn)定機構(gòu)導(dǎo)致的。企業(yè)的問題是存在有些公司缺乏研發(fā)領(lǐng)域的專家加上研發(fā)項目的資源不足，導(dǎo)致開展的研發(fā)活動沒能順利進行，錯過了高新企業(yè)申報時機；認(rèn)定機構(gòu)的問題是對企業(yè)的研發(fā)活動難以認(rèn)定，如企業(yè)是否通過研究開發(fā)活動在技術(shù)、工藝、產(chǎn)品（服務(wù)）方面的創(chuàng)新取得了有價值的成果，是否對本地區(qū)相關(guān)行業(yè)的技術(shù)、工藝具有推動作用。

（二）高新企業(yè)申報研發(fā)費用歸集問題

1、在實際執(zhí)行中，存在一些尚未設(shè)立專門研發(fā)機構(gòu)的企業(yè)，這些企業(yè)在核算和歸集研發(fā)費用沒法做到合理無誤，對可以進行加計扣除政策的研發(fā)費用難以確定；

2、工作指引中較明確規(guī)定了直接投入的開支范圍，但企業(yè)實際操作中會出現(xiàn)研發(fā)費中的材料費品種繁多，部分領(lǐng)料單上亦未寫明具體用于什么研究開發(fā)項目的情況；

3、很多進行高新企業(yè)申報的企業(yè)特別是中小型企業(yè)并沒有獨立設(shè)置研發(fā)費用科目，就將發(fā)生的研發(fā)費分別記錄在不同的會計科目上，導(dǎo)致無法核算研發(fā)項目的研發(fā)費用。

（三）委托研發(fā)費用真實性難以核實。

企業(yè)研發(fā)費用稅前扣除有規(guī)定，如果企業(yè)委托給外單位進行研發(fā)，受托方應(yīng)提供該研發(fā)費用支出明細(xì)情況。但受托方提供資料的真實性難以保證，稅務(wù)部門如果不進行延伸檢查，就無法辨別真實性。特別是當(dāng)受托方為異地注冊的企業(yè)，稅務(wù)部門會受行政管轄權(quán)的限制。

產(chǎn)生上述問題的原因是多方面的，企業(yè)要對研發(fā)的相關(guān)問題進行討論并及時解決，確保企業(yè)的財務(wù)數(shù)據(jù)合理準(zhǔn)確，證實企業(yè)的研發(fā)能力水平符合高新企業(yè)申報的標(biāo)準(zhǔn)要求。