蛋白質(zhì)分離器又叫泡沫分離器，它利用氣體的張力來吸附水中小顆粒的懸浮物。蛋白質(zhì)分離器的主體是一個反應(yīng)桶，反應(yīng)桶的下部一般安裝有一個造泡裝置，它會產(chǎn)生大量細的氣泡，氣泡由于浮力的作用不斷上升，在上升的過程中能將水中懸浮物攜帶到反應(yīng)桶的頂部，再從溢泡管中溢出，從而達到撇除水中的懸浮物顆粒的目的。

因為水中的懸浮物大部分為有機物和含有有機氮，所以蛋白質(zhì)分離器可以將這些物質(zhì)在被分解之前去除，避免這些物質(zhì)轉(zhuǎn)發(fā)成氨氮或硫化氫等對水生生物有害的可溶物，因此蛋白分離器又被稱作化氮器。

蛋白質(zhì)分離器的構(gòu)造比較特殊，因此它能撇除的懸浮物顆粒范圍包括20-80um，而顆粒更大的懸浮物應(yīng)用其他過濾設(shè)備事先過濾掉。