在自然海域中，海馬通常喜歡生活在珊瑚礁的緩流中，因為它們不善于游水，故而經(jīng)常用它那適宜抓握的尾部緊緊勾勒住珊瑚的枝節(jié)、海藻的葉片上，將身體固定，以使不被激流沖走。而大多數(shù)種類的海馬生長在河口與海的交界處，因而，它們能適應不同濃度的海水區(qū)域，甚至在淡水中也能存活。海馬和海馬的嘴很小，并且只宜覓食活餌，而不善于游水的它們又不能迅捷地捕食。

海馬因其擬態(tài)適應特性，習性也較特殊，喜棲于藻叢或海韭菜繁生的潮下帶海區(qū)。性甚懶惰，常以卷曲的尾部纏附于海藻的莖枝之上，有時也倒掛于漂浮著的海藻或其他物體上，隨波逐流。即使為了攝食或其他原因暫時離開纏附物，游泳一段距離之后，又找到其他物體附著之上。

海馬的游泳姿勢十分優(yōu)美，魚體直立水中，完全賴以背鰭和胸鰭高頻率地作波狀擺動（每秒鐘10次）而作緩慢的游動（每分鐘僅達1～3米）。海馬的活動一般多在白天（上午和下午），晚上則呈靜止狀態(tài)。海馬在水質(zhì)變劣、氧氣不足或受敵害侵襲時，往往因咽肌收縮而發(fā)出咯咯的響聲，這給養(yǎng)殖者發(fā)出“求救”的信號，但在攝食水面上的餌料時也會發(fā)聲，應加以區(qū)別。

無論是熱帶的水域、溫帶的水域、淺水區(qū)、約百米深的海洋，甚至是淡水區(qū)都有它們的影蹤。水母早在六億五千萬年前就存在了，它們的出現(xiàn)甚至比恐龍還早。全世界的水域中有超過250余種的水母，它們分布于全球各地的水域里。全部生活在海洋中。