高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定專項(xiàng)審計(jì)，是指注冊(cè)會(huì)計(jì)師接受擬向有關(guān)部門申請(qǐng)進(jìn)行高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定的申報(bào)企業(yè)委托，對(duì)其近三個(gè)會(huì)計(jì)年度(實(shí)際經(jīng)營(yíng)不滿三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限)的研究開發(fā)費(fèi)用結(jié)構(gòu)明細(xì)表和近一個(gè)會(huì)計(jì)年度的高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細(xì)表進(jìn)行審計(jì)，并出具專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告。

申報(bào)明細(xì)表與年度財(cái)務(wù)報(bào)表相關(guān)聯(lián)，是指企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度研究開發(fā)費(fèi)用結(jié)構(gòu)明細(xì)表和近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細(xì)表的相關(guān)數(shù)據(jù)包含在已審計(jì)的年度財(cái)務(wù)報(bào)表中，兩者適用的會(huì)計(jì)準(zhǔn)則或會(huì)計(jì)制度是一致的，在相關(guān)會(huì)計(jì)政策、會(huì)計(jì)估計(jì)方面不存在差異。

申報(bào)明細(xì)表又區(qū)別于年度財(cái)務(wù)報(bào)表。企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度研究開發(fā)費(fèi)用結(jié)構(gòu)明細(xì)表和近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細(xì)表是按照《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》和《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作指引》編制的，其列報(bào)的數(shù)據(jù)可以直接反映出企業(yè)是否滿足認(rèn)定條件。

高新審計(jì)依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定辦法相關(guān)規(guī)定，企業(yè)申請(qǐng)高新認(rèn)定，需要對(duì)近三年的財(cái)務(wù)狀況、研發(fā)費(fèi)用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入情況進(jìn)行審計(jì)，出具審計(jì)專項(xiàng)報(bào)告和年度審計(jì)報(bào)告。

會(huì)計(jì)師會(huì)結(jié)合企業(yè)情況，給出一份準(zhǔn)備材料的清單。主要是企業(yè)的資產(chǎn)負(fù)債表、損益表、總賬、明細(xì)賬、科目余額表(到末級(jí)科目)、財(cái)務(wù)憑證、公司的執(zhí)照、章程等等。