財務軟件需要到財政局備案方可使用，有的代理記賬單位沒有采用財政部批準的財務軟件來替代手工記賬。

會計資料交接麻煩、不夠規(guī)范。代理記賬單位在接受委托單位的會計原始憑證及資料時，沒有辦理交接手續(xù)，發(fā)現遺失或毀損時無法查找。

代理記賬機構的數量在不斷增加，但整體規(guī)模普遍較小，代理業(yè)務范圍不寬。真正能提供受托單位會計核算、稅收籌劃、納稅申報、內部審計、工商稅務注冊年檢、財稅咨詢等會計服務的機構很少。

會計核算方面尚存在許多不規(guī)范之處，一些會計核算未能以權責發(fā)生制為基礎，對所代理公司未按《公司法》計提法定公積金、法定公益金的現象也較普遍，代理編制的年度財務會計報告都只有基本會計報表，均未按制度規(guī)定的要求提供會計報表附注的內容等。

業(yè)務范圍

1、代理各個稅種的納稅申報，代理企業(yè)納稅情況自查及清算各種稅款業(yè)務;

2、代理企業(yè)整體稅務安排、投資項目稅收評估，代理制作涉稅文書。

3、建立企業(yè)納稅核算體系用辦稅制度，為企業(yè)設計財務制度。

4、協助企業(yè)進行股份制改及企業(yè)間兼并、收購工作，代理設計經營管理制度。

5、為企業(yè)提供報表分析，提供其他管理建議。

6、委托人要求的其他常年代理業(yè)務。

有百分之九十八的代理記賬機構會提供整理原始憑證、編制會計憑證、登記賬冊、編制會計報表、納稅申報五項基本服務。