北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所與醫(yī)院主體并稱“一院三所”，成為集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、國際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為教育部批準(zhǔn)的國家臨床重點學(xué)科，變態(tài)反應(yīng)(鼻過敏)科為原國家衛(wèi)生和計劃生育委員會批準(zhǔn)的國家臨床重點?？?，中醫(yī)眼科學(xué)為國家中醫(yī)藥管理局批準(zhǔn)的中醫(yī)重點學(xué)科。首都醫(yī)科大學(xué)北京眼科學(xué)院和耳鼻咽喉科學(xué)院設(shè)在院內(nèi)。醫(yī)院設(shè)有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，附設(shè)北京同仁眼庫(國際眼庫協(xié)會會員)。

改革開放以來，醫(yī)院共獲得省部級以上科技成果獎勵138項，其中8項，獲得國家自然科學(xué)基金資助項目253項。

同仁醫(yī)院歷經(jīng)百余年發(fā)展，凝練出“精誠勤和”的醫(yī)院精神。在新的歷史時期，同仁人將繼承和發(fā)揚(yáng)百年同仁優(yōu)良傳統(tǒng)，弘揚(yáng)主流文化，苦練內(nèi)功，精于內(nèi)涵，團(tuán)結(jié)一致，創(chuàng)新發(fā)展，努力為人民群眾提供優(yōu)質(zhì)、、快捷的醫(yī)療服務(wù)。

對于一些特殊性的科室（性病、特殊病等），可以做完全保密，完成門診預(yù)約，做人性化服務(wù)和信息化的科學(xué)結(jié)合。用戶如果通過電話掛號之后，當(dāng)日并沒有趕到醫(yī)院，則過期自動退號，掛號費(fèi)自動退回用戶賬號。

預(yù)約掛號，掛專家號更是“一號難求”,這是當(dāng)前許多大型醫(yī)院的普遍現(xiàn)象。預(yù)約掛號是各地近年來開展的一項便民就醫(yī)服務(wù)，旨在縮短看病流程，節(jié)約患者時間。這種預(yù)約掛號大多通過醫(yī)療機(jī)構(gòu)提供的電話或者網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行，基本上是免費(fèi)或者只收取很少的手續(xù)費(fèi)。由于預(yù)約掛號需要事先登記患者的信息，并且可以減少在醫(yī)院掛號窗口排隊等待之苦，因此它一定程度上也有利于改善就醫(yī)環(huán)境，促進(jìn)“實名制”的推行，受到了不少患者的肯定和歡迎。