銀行承兌匯票是銀行到期無條件付款，承兌銀行見到到期的銀行承兌匯票后，只要審核匯票背書連續(xù)及匯票的真實性后即可付款：而國內信用證開證(議付)行必須審核信用證及其所附單據(jù)，保證單證相符、單單相符后方可付款。銀行承兌匯票一般都是在匯票到期日由承兌銀行支付款項，而國內信用證的付款期限可分為即期付款和延期付款(兩者都要在信用證有效期內)，即期付款是指開證行在收到受益人提交的符合信用證要求的單據(jù)后，立即向受益人支付款項(一般是在五個工作日內)，延期付款是指在貨物發(fā)運日后某一日付款。其中，即期付款的國內信用證和銀行承兌匯票不同，它沒有到期日的概念，隨到隨付。
銀行承兌匯票貼現(xiàn)時，受理銀行雖然要求提供能夠證明該銀票項下的交易確已履行的憑證(包括與其直接前手之間的增值稅發(fā)票和貨運單據(jù))，但貼現(xiàn)銀行到期辦理委托收款時不再需要附這些證明單據(jù)。實際上，只要保證匯票本身的真實性和背書連續(xù)，承兌銀行就必須付款。實際工作中，大多數(shù)銀行在辦理銀行承兌匯票貼現(xiàn)時，出于各種各樣的原因，對增值稅發(fā)票、運輸單據(jù)的審查往往只是流于形式。因此，兩者雖然都要求有貿易背景，相比之下國內信用證更加強調商品交易履行合同的真實性。
國內信用證可以根據(jù)買方，或者賣方的要求進行修改，往往是貿易雙方對合同上的條款進行了修改，相應地對信用證上的條款也進行修改，甚至修改信用證金額，這就給交易雙方帶來了方便。而銀行承兌匯票上的金額不能進行修改，也不能對部分金額進行背書轉讓，只能以此金額終辦理結算。這也是一些客戶將大額銀行承兌匯票質押給銀行，重新簽開若干小額承兌匯票用于不同用途支付的主要原因。
根據(jù)《支付結算辦法》，企業(yè)申請辦理銀行承兌匯票只要交納萬分之五的手續(xù)費，辦理貼現(xiàn)時不須再交納手續(xù)費，而國內信用證由于手續(xù)比較復雜，在整個業(yè)務環(huán)節(jié)，企業(yè)要交納相對較多的費用?！秶鴥刃庞米C結算辦法》中要求，企業(yè)在申請開證時，要交納開證手續(xù)費(按開證金額的0．15％收取，100元)；申請修改信用證時，按每筆100元交納修改手續(xù)費，增額修改的，對增額部分按開證手續(xù)費標準收取，少不低于100元，不另收修改手續(xù)費；通知行通知受益人時，受益人交納通知手續(xù)費每筆50元；受益人辦理議付時，按議付金額0．1％交納議付手續(xù)費。