醫(yī)院技術(shù)力量雄厚。擁有重點學(xué)科兒科學(xué)，國家兒童腫瘤監(jiān)測中心、國家呼吸系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心、國家中西醫(yī)協(xié)同旗艦醫(yī)院試點單位等12個平臺，8個國家臨床重點?？疲?個北京市重點實驗室，2個北京市級研究平臺以及16個市級醫(yī)療中心。醫(yī)院設(shè)有疑難罕見病例會診中心和遠程會診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內(nèi)地位，是中華醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會、兒外科分會，中國醫(yī)師協(xié)會小兒外科醫(yī)師分會，中華護理學(xué)會兒科專業(yè)委員會主任委員單位。
目前科室開展異基因造血干細胞移植和自體造血干細胞移植，異基因造血干細胞移植包括HLA配型全相合移植和半相合(單倍體)移植，干細胞來源包括骨髓、外周血、臍帶血。目前造血干細胞移植千余例，其中2/3為單倍體造血干細胞移植。病種包括白血病、淋巴瘤、神經(jīng)母細胞瘤、再生障礙性貧血、噬血細胞綜合征、慢性EB病毒感染等兒童血液腫瘤疾病，也包括石骨癥、腦白質(zhì)營養(yǎng)不良、免疫缺陷病等先天遺傳代謝性疾病。依托于國家兒童醫(yī)學(xué)中心多學(xué)科技術(shù)支持，對難治/復(fù)查白血病及腫瘤疾病、先天遺傳代謝病、免疫相關(guān)疾病、小年齡組患兒以及復(fù)雜重癥病例的移植經(jīng)驗豐富，現(xiàn)為國內(nèi)的石骨癥的移植中心，同時在噬血細胞綜合征及慢性活動性EB病毒感染及相關(guān)疾病的也處于國際水平。結(jié)合兒科病人的特點，相對于其他移植中心，更注重了對移植前后病人的生存質(zhì)量、營養(yǎng)管理、生長發(fā)育的監(jiān)測及干預(yù)。設(shè)有由專業(yè)醫(yī)護、心理及醫(yī)務(wù)社工團隊組成的舒緩小組，對患兒進行疼痛癥狀管理，患兒及家長的心理疏導(dǎo)，進一步提高患兒的生存質(zhì)量。
耳鼻咽喉頭頸外科學(xué)科帶頭人倪鑫，國家兒童醫(yī)學(xué)中心主任，首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京兒童醫(yī)院院長，主任醫(yī)師，教授，博士生導(dǎo)師。
耳鼻咽喉頭頸外科教授團隊:倪鑫、鄭軍、葛文彤、張杰、劉海紅、許志飛、郭永麗、王生才等。
首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京兒童醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科于1975年建科，2023年4月獲批國家重點臨床專科，成立至今已經(jīng)有近50年歷史?？剖颐嫦蛉珖鴥和颊撸栽\治耳鼻咽喉及頭頸部常見病和疑難危重疾病為主，是中華醫(yī)學(xué)會耳鼻咽喉頭頸外科分會小兒學(xué)組組長單位和中國醫(yī)師協(xié)會耳鼻咽喉頭頸外科分會小兒學(xué)組組長單位。現(xiàn)下設(shè)四個臨床專業(yè)和三大臨床診療中心，即耳科專業(yè)、鼻科專業(yè)、咽喉專業(yè)和頭頸專業(yè)以及兒童睡眠中心、兒童聽力診療中心和人工耳蝸中心。依托國家兒童醫(yī)學(xué)中心發(fā)展平臺，聯(lián)合首都醫(yī)科大學(xué)兒童上氣道阻塞性疾病臨床診療與研究中心、兒童耳鼻咽喉頭頸外科疾病北京市重點實驗室兩大科研支撐平臺，進行臨床-科研-教學(xué)三位一體的學(xué)科建設(shè)，目前已基本建成國內(nèi)、國際先進的兒童耳鼻咽喉頭頸疾病綜合性基礎(chǔ)和臨床研究平臺。
科室現(xiàn)擁有醫(yī)療床位34張，睡眠中心床位12張，年門診量約20萬人次，年手術(shù)量3500余例?？剖夜灿嗅t(yī)師46人、研究員2人、副研究員1人及技術(shù)人員18人。醫(yī)師中主任醫(yī)師18人，副主任醫(yī)師12人，主治醫(yī)師9人，住院醫(yī)師7人?？剖椰F(xiàn)有教授5人，副教授2人，講師9人;博士研究生導(dǎo)師6人，碩士研究生導(dǎo)師1人。
科室擁有多種國內(nèi)外的耳鼻咽喉頭頸外科醫(yī)療設(shè)備，如達芬奇機器人操作系統(tǒng)，美敦力顱神經(jīng)電生理監(jiān)測系統(tǒng)，美敦力ENT電磁導(dǎo)航系統(tǒng)，超聲刀系統(tǒng)，蔡司顯微鏡，STORZ超高清鼻內(nèi)鏡系統(tǒng)等，可充分滿足對兒童耳鼻咽喉頭頸外科所有病種的臨床診療需求。
開展的特色診療項目包括特發(fā)性眼球震顫等復(fù)雜斜視的手術(shù)及發(fā)病機制研究，兒童及嬰幼兒角膜移植手術(shù)，兒童眼球震顫及白內(nèi)障術(shù)后個性化視覺功能重建，早產(chǎn)兒視網(wǎng)膜病變的綜合診治，Ritleng淚道插管手術(shù)、微創(chuàng)淚道重建術(shù)、鼻內(nèi)窺鏡鼻腔淚囊吻合術(shù)等復(fù)雜兒童淚道疾病、利用GORE-TEX新型材料進行額肌懸吊術(shù)兒童上瞼下垂，先天性小瞼裂綜合征微創(chuàng)手術(shù)，視網(wǎng)膜母細胞瘤的個性化綜合， 360°微導(dǎo)管引導(dǎo)下小梁切開術(shù)先天性青光眼等。