先后獲國(guó)家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)2項(xiàng)、省部級(jí)一等獎(jiǎng)4項(xiàng)、何梁何利科學(xué)技術(shù)與進(jìn)步獎(jiǎng)，談家楨生命科學(xué)臨床醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)，轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)杰出貢獻(xiàn)獎(jiǎng)，吳階平醫(yī)藥創(chuàng)新獎(jiǎng)，中國(guó)工程院光華工程科技獎(jiǎng)。北京大學(xué)人民醫(yī)院血液科黃曉軍加急住院掛號(hào)

黃曉軍教授主持國(guó)家863計(jì)劃、國(guó)家杰出青年基金、國(guó)家自然基金重點(diǎn)項(xiàng)目等國(guó)家項(xiàng)目，在白血病等惡性血液病的、診斷等方面進(jìn)行了系統(tǒng)性和開創(chuàng)性工作，以或通訊作者身份在新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志（New Eng J Med，2篇）、臨床腫瘤學(xué)（J Clin Oncol，1篇）、血液學(xué)（Blood，6篇）、白血病（Leukemia，5篇）等國(guó)際期刊發(fā)表SCI論文190篇，主編專著20部。牽頭制定多項(xiàng)中國(guó)及亞太血液病指南/標(biāo)準(zhǔn)并推廣普及，主持我國(guó)高水平多中心臨床研究，領(lǐng)導(dǎo)建設(shè)中國(guó)造血干細(xì)胞移植登記數(shù)據(jù)庫(kù)、慢性髓性白血病聯(lián)盟，促進(jìn)我國(guó)血液病診治的規(guī)范化及人才建設(shè)。

“北京方案”改變了全球造血干細(xì)胞移植的格局，近3年已成為我國(guó)來(lái)源類型的移植方式，也促進(jìn)了歐美單倍體移植的快速發(fā)展，使造血干細(xì)胞移植進(jìn)入“人人都有供者”的新時(shí)代. 主要貢獻(xiàn)如下： （1） 發(fā)展完善了國(guó)際原創(chuàng)的單倍體移植體系：突破免疫屏障，使造血干細(xì)胞移植這種白血病方法不再限于“配型相合”，“父母供子女，子女供父母”等“單倍體移植”模式取得與全合移植相同療效。此體系的發(fā)展與應(yīng)用成功解決了“供者匱乏”這一困擾全世界的關(guān)鍵臨床問(wèn)題，迎來(lái)了“人人都有移植供者”新時(shí)代。 （2）移植合并癥防治：建立了以分層乃至個(gè)體化為特色的移植后白血病復(fù)發(fā)及移植物抗宿主病新型防治體系，臨床上實(shí)現(xiàn)了抗白血病效應(yīng)和移植物抗宿主作用分離，提高了患者生存。 （3）白血病分層與靶向：國(guó)際上首次證實(shí)口服砷劑可替代靜脈砷劑急性早幼粒細(xì)胞白血?。ˋPL），在此基礎(chǔ)上證實(shí)非高危APL患者口服砷劑聯(lián)合維甲酸即可獲長(zhǎng)期生存，首次實(shí)現(xiàn)了不輸液、不化

2007年擔(dān)任國(guó)家杰出青年科學(xué)基金項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)帶頭人。負(fù)責(zé)承擔(dān)國(guó)家自然科學(xué)基金國(guó)家“863”基金、“985”基金、北京大學(xué)211基金、衛(wèi)生部基金、教育部博士點(diǎn)和“新世紀(jì)人才”等多項(xiàng)基金。發(fā)表論文100多篇，綜述10多篇，專著10部。1996年被評(píng)為碩士研究生導(dǎo)師，1999年獲北京市醫(yī)務(wù)工作者，2003年獲北京市五、四青年稱號(hào)，被評(píng)為博士生導(dǎo)師。2005年被評(píng)為教育部“新世紀(jì)人才”。在2006年獲中華醫(yī)學(xué)科技獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)，2008年衛(wèi)生部吳楊獎(jiǎng)獲得者，2008年中國(guó)醫(yī)師獎(jiǎng)獲得者。