①農(nóng)藥殘留檢測(cè)儀器：主要是氣相色譜儀(GC)加液相色譜儀(HPLC)輔助檢測(cè)，當(dāng)物質(zhì)較為簡(jiǎn)單時(shí)，用氣相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC–MS)定性檢測(cè)，當(dāng)基質(zhì)較為復(fù)雜時(shí)，用 LC–MS 甚至用 GC–MS–MS 確證。

②有害化合物殘留、漁藥和獸藥殘留檢測(cè)儀器：由于這類殘留物較復(fù)雜，一般用液相色譜儀進(jìn)行檢測(cè)為主，以氣象色譜儀、離子色譜(IC)、薄層色譜(TLC)等輔助檢測(cè)。當(dāng)需要做多種殘留快的速檢驗(yàn)，幾乎均用 LC–MS–MS。

③有害元素及其價(jià)態(tài)的檢測(cè)儀器：常用的檢測(cè)儀器是原子熒光光譜儀(AFS)、原子吸收光譜儀(AAS)、電感耦合等離子光譜儀(ICP)和具有更高靈敏度的 ICP–MS；為鑒定元素的價(jià)態(tài)，一般采用元素分析儀與各種色譜分離系統(tǒng)聯(lián)用。

④病源性檢測(cè)儀器：傳統(tǒng)的檢測(cè)儀器是用鏡檢和菌落計(jì)數(shù)器等，目前用于、致病菌鑒定的儀器有六種以上。廣為應(yīng)用的儀器包括基因檢測(cè)儀器、碳源代謝利用率檢測(cè)儀器、生物芯片技術(shù)平臺(tái)、基于表面等離子諧振(SPR)儀器及基于特征脂肪酸譜的儀器。