難點一：實驗室檢測技術能力達不到要求

公正性和準確性是國家實驗室必須達到的要求，所謂公正性就是實驗室相對獨立，如：儀器獨立，場地獨立，人員獨立等，所謂準確性就是檢測結果需要準確無誤。

大部分企業(yè)不夠重視實驗室，原因是實驗室屬于企業(yè)的后臺，故配置的設備和人員都比較少，檢測技術也達不到要求，如若要申請國家實驗室認可需要配置足夠的人員和設備，滿足國家認可相關標準。

難點二：實驗室設計布局及環(huán)境不滿足要求

大部分實驗室設計布局都不滿足要，相互干擾的設備放在一起，如：鹽霧和其它設備放一起，有機無機未分開，振動設備和其它設備放一起，輻射的設備與其它設備放一起等，設備之間的相互干擾會影響檢測結果的準確性。

實驗室環(huán)境也很重要，如果環(huán)境不滿足要求，將不滿足國家認可要求，常見的環(huán)境問題為：實驗室氣壓，塵埃粒子，照度，溫度，濕度，輻射，背景噪音，風速，風向等。

難點三：實驗室質量控制達不到要求

實驗室質量控制是國家認可過程中評審的重點，主要是：期間核查，不確定度，方法確認，平行樣檢測，加標回收率（化學），標準品管理、校準曲線控制（化學）、空白樣控制（化學）、實驗室間的比對、實驗室內的比對等。

實驗室的質量控制是實驗室長期提高的一個過程，關注細節(jié)和流程，需要從很多方面來考慮，如：人、機、料、法、環(huán)、測等。